Poco después de haber emergido de la sopa de la vida, los mushi, o criaturas mortíferas muy básicas, que no son como el resto de seres que conocemos, son seres con podere sobrenaturales, que habitan nuestro mundo aunque no podamos verlos a simple vista. Aquí e... Poco después de haber emergido de la sopa de la vida, los mushi, o criaturas mortíferas muy básicas, que no son como el resto de seres que conocemos, son seres con podere sobrenaturales, que habitan nuestro mundo aunque no podamos verlos a simple vista. Aquí es donde entra el protagonista, Ginko (ギンコ), que se dedica a investigar a los Mushi y ayudar a la gente que se encuentra con ellos. Él, es el Mushishi, el maestro de los Mushi.
